Profesor Nagasaki y Profesor Kawaguchi del Centro de Medicina Genómica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Kyoto

El TS-2483XU-RP de alto rendimiento acelera y optimiza el análisis de datos genómicos.

  • Antecedentes

    El Profesor Nagasaki y el Profesor Kawaguchi del Centro de Medina Genómica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Kyoto estudian genomas, metabolitos e información médica con el principal objetivo de buscar factores relacionados con enfermedades en humanos. Llevan a cabo un análisis de datos a gran escala de decenas de miles de personas.

  • Retos

    El genoma contiene 3.000 millones de pares de bases (3GB) por persona y, al analizar el genoma, es necesario procesar una cantidad de datos extremadamente alta. Por tanto, necesitábamos un almacenamiento de alto rendimiento. Los profesores utilizaban antes un almacenamiento RAID conectado a cada servidor informático como almacenamiento "nearline" local para albergar los datos. Con este método, la velocidad de E/S era un cuello de botella y los datos estaban literalmente repartidos entre varias unidades de almacenamiento, lo que dificultaba su uso por parte de los investigadores.

Solución

Los profesores instalaron tres NAS TS-2483XU-RP de QNAP para lograr una alta velocidad de E/S con disponibilidad de piezas después de la garantía, un coste económico y una portabilidad más sencilla (cuando sea necesario reubicar físicamente el NAS). El TS-2483XU-RP es un NAS de 24 bahías de alto rendimiento equipado con procesadores Intel ® Xeon® E con hasta 128 GB de memoria DDR4 ECC y dos puertos SFP+ 10GbE. Los profesores también instalaron otros sistemas de almacenamiento distribuido de alta velocidad y los integraron con el almacenamiento "nearline", formado por NAS de QNAP destinados a almacenar los datos por separado en función de su finalidad. Los datos de análisis se guardan en el almacenamiento más rápido y los datos de base se almacenan como datos fríos, ya que son esenciales pero no se suele acceder a ellos.

Resultados

Los profesores se hicieron con una completa suite de almacenamiento de QNAP, lo que les permitió reducir considerablemente los costes de administración y aprendizaje gracias a una interfaz de administración centralizada y a una configuración basada en GUI. El NAS de QNAP es fácil de instalar y se ha convertido en una herramienta indispensable para intercambiar datos con instituciones externas. Les ha permitido mejorar la facilidad de uso mediante el acceso centralizado a los datos y crear un sistema de almacenamiento asequible que responde a las necesidades de E/S. Los profesores están creando un entorno de nube híbrida que combina tres infraestructuras: servidores locales, nubes públicas y una Infraestructura informática de alto rendimiento interdisciplinar (también conocida como superordenadores) en la red de información académica SINET*. Los profesores no solo han utilizado los NAS de QNAP como almacenamiento "nearline", tal y como pensaban, sino que también los utilizan como un entorno de E/S directo de los clústeres informáticos. En el futuro, los profesores tienen pensando crear un entorno con menos interrupciones en el que estén centralizados los datos de cada plataforma y los usuarios puedan usar los datos que deseen sin percatarse de las diferencias entre las distintas plataformas y aplicaciones.

*SINET es la infraestructura de red de TI de las universidades e institutos de investigación japoneses.

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